本所之前身為秀林鄉公所戶籍課，民國58年戶警合一，在鄉公所合併辦公，於民國63年自鄉公所搬遷到現址（秀林村12鄰秀林78號）單獨辦公，改隸花蓮縣警察局，迄民國81年7月1日戶警分立止，本所改隸於花蓮縣政府。 歷年來在鄧洪禧、曾燦光、杜宗亞、王希達、陳聰明、李衍華、邱乾煥等主任的領導下，不斷改善服務品質，陳聰明主任更積極爭取辦公廳舍的改建，於87年5月1日新辦公室落成啟用，使服務同仁及洽公鄉親能有一舒適之環境；現任主任吳敏賢於112年4月11日調任現職後在服務態度，服務品質及行政效率方面更積極爭取各項設備，以顧客導向為施政目標，提供簡政便民革新的創新服務，並時時以「勤政、廉民、愛斯土」與同仁共勉。